[植物Plantae] 尼龙菌威胁了进化论？

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銀琉迦

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第二章

麵包是銀子家的乃們這些魂淡淡不准跟窩搶><！

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发表于 2012-10-7 09:36:18 | 显示全部楼层 |阅读模式

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本帖最后由銀琉迦于 2012-10-7 09:40 编辑

好吧我承认我跟进化论纠结上了╮(￣▽￣")╭

关于进化论的上一篇文章：https://www.gn00.com/t-138700-1-1.html

[学术]嘲笑进化论？质疑进化论？

本文出自：http://www.tianya.cn/publicforum/content/no01/1/406635.shtml

作者：xxl4457

发表日期：2009-10-14 14:04:00

关天上批判进化论的帖子可谓一波又一波，每月总有那么几次。这种热情是我在网络别处闲逛时比较少见的。曾经参与了讨论进化论的长贴，发现对进化论的反驳总是固定的套路。而且有一些观点总是不厌其烦地重复出现，哪怕是被证伪的。

　　也许“如果认真，你就输了”的态度更好。但抱着“拯救关天智商”的想法，加上找到难得的好资源，就半翻译地发表这个帖子，介绍一下分子生物学领域出现过的有趣发现。　
　　
　　许多攻击进化论的帖子也与时俱进地谈到了DNA，比如这个：http://www.tianya.cn/publicforum/content/no01/1/320102.shtml
　　其中的一个观点很明确：　突变的概率不足以产生新的适应性。听着他们摆着手指头一算，貌似还有那么些道理，加上达尔文同学确实不知道DNA为何物，起码会让人产生些迷惑吧。
　　
　　正如没有那次环球旅行，就不会有《物种起源》一样；如果没有实证，任何“理论”都会失去对现实的影响。而在数十年前，生物学家们就已经找到了一种有趣的生物，来佐证突变产生适应性的假设。
　　
　　这种奇异的生物只是一种细菌。Flavobacterium，Sp。K172，aka“尼龙菌”。1975年在一个废水池中由日本科学家发现。（勤劳的日本科研员，你说他们怎么会去废水池捞东西的？难道是找忍者神龟？）它所分泌的酶可以帮助它消化尼龙。而尼龙，是一种在1935年才出现的人造材料。这种细菌，虽然其使用的酶效率比较低（只有一般酶的２％），但是它可以靠这种方式吃尼龙过活，更有意思的是，它们无法享用普通细菌食用的碳水化合物；而且，这种细菌的出现并非只有一次。　
　　
　　也就是说，这是一种在1935年后才出现的生物！
　　
　　感谢分子生物学，我们已经弄清了尼龙菌出现的机理；抑或说，尼龙菌【演化】的机理：　移码突变（frameshiftmutation）
　　
　　所谓移码突变，指的是DNA序列中的一个单位（AGCT）出现丢失或插值，导致整个序列整体移位的情况。
　　
　　当序列整体移位时，组装出的氨基酸也会发生错误。拿ASCII码为例，b(1100010)，e(1100101)，andd(1100100)组成了单词bed(110001011001011100100);若是最左边多了一个1而忽略了最后的0，单词就变为q2r(q(1110001)，2(0110010)，andr(1110010))。绝大多数情况下，错误的氨基酸和q2r一样，成为了没有意义的单词。一次没有益处的变异。
　　
　　但是，某些时候移位的序列会组装出新的单词：把g(1100111)+a(1100001)+s(1110011)如上操作，可以得到s(1110011)+p(1110000)+y(1111001)。而在尼龙菌的例子里，插值的不是1，而是一个T。
　　
　　仅仅是这一个意外的T，旧的基因编码：氨基酸精氨酸，谷氨酸，精氨酸，苏氨酸，苯丙氨酸，组氨酸，精氨酸和脯氨酸（Arginine，GlutamicAcid，Arginine，Threonine，Phenylalanine，Histidine，ArginineandProline）被改成了：天冬酰胺，丙氨酸，精氨酸，丝氨酸，苏氨酸，甘氨酸和谷氨酰胺（Asparagine，Alanine，Arginine，Serine，Threonine，GlycineandGlutamine）。而这些意外的氨基酸，则组成了和原先完全不同的蛋白质。
　　
　　这个意外的蛋白质所构成的新酶，恰恰具有分解尼龙的能力。于是在一个日本的污水坑中，一个原本以糖为生的细菌转身成为了啃尼龙的怪物。
　　
　　在简单的逻辑与新奇的科学发现之下，突变可以产生新的适应性的说法，被证实了。
　　
　　
　　新的发现总会引起争论与探讨。在后来的研究发现，插值的那个T，来自于细菌质粒（Plasmid），一种在细菌中常见的DNA“编外人员”，即游离在染色体外的DNA分子。于是设计论者提出：嘿，也许这个消化尼龙的能力早就埋藏在质粒里，或者这个氨基酸纯粹就是从别的细菌那里借过来的。９９年的日本科学家发表了文章，推翻了这种假设。首先，提供Ｔ的质粒是这种细菌自产的。其次，这个质粒只是偶然地提供了一个Ｔ，此外就与变异前的细菌无二了。如果这种基因设计早已存在，那么这个细菌几亿年来的苦苦等候，只是为了数十年前一次与尼龙的偶然邂逅？　

　　其实如果抛弃智慧设计论的观点，我们可以从尼龙菌的例子更好地理解随时随地在所有生物身体中发生的，制造新蛋白质的例子。比如竽螺，　这种分泌最毒毒液的凶狠捕食者，它的体内简直就是一个蛋白质工厂。复杂，而又迅猛变化的多种蛋白混合体促成的猛毒，使这些躺在水底，移动力几乎为零的软体动物可以享用鱼类大餐。
　　
　　尼龙菌的出现会引起另一类演化论者，　也就是拉马克同学支持者的兴趣。“你看，因为尼龙的存在而出现的吃尼龙的细菌”，和长颈鹿的脖子一个道理嘛。在这一点上，1952时Esther和JoshuaLederberg就通过实验证明了，突变是随机的，不会因环境导向而出现方向性。也就是说，细菌们的变异一直存在着，当抗生素存在时，只有那些变异出抗药性的细菌得以存活而体现了演化的方向。　　
　　
　　有关尼龙菌的论文：

"PurificationandCharacterizationof6-Aminohexanoic-Acid-OligomerHydrolaseofFlavobacteriumsp.K172，"Kinoshita，et.al.，Eur.J.Biochem.116，547-551(1981)，FEBS1981.
　　"Birthofauniqueenzymefromanalternativereadingframeofthepre-existed，internallyrepetitiouscodingsequence"，SusumuOhno，Proc.Natl.Acad.Sci.USA，Vol.81，pp.2421-2425，April1984
　　"SequenceanalysisofacrypticplasmidfromFlavobacteriumsp.KP1，apsychrophilicbacterium，"MakotoAshiuchi，MiaMd.Zakaria，YurikoSakaguchi，ToshiharuYagi，FEMS(FederationofEuropeanMicrobiologicalSocieties)MicrobiologyLetters170(1999)，243-249
　　http://en.wikipedia.org/wiki/Nylon-eating_bacteria
　　此文主题内容转译自新墨西哥州科学与理性协会ＮＭＳＲ网页：http://www.nmsr.org/nylon.htm
　　（感谢NMSR，虽然新墨西哥除了不少狗血的家伙，但进步与理性之光依旧存在）
　　有关移码突变：http://en.wikipedia.org/wiki/Frameshift_mutation
　　有关质粒（Plasmid）：http://en.wikipedia.org/wiki/Plasmid
　　有关1952Esther和JoshuaLederberg　实验：　http://evolution.berkeley.edu/ev ... IC1bLederberg.shtml
　　
　　
　　后记：　

　　1.质疑主义是科技进步的前进力量之一。但当质疑者携带着自己的私货时，一切就不显得那么美好了。当一个数十年前就存在的小小细菌依旧被国人忘记，在主流论坛反反复复宣扬着可被证伪的观点时，一个搬运者的工作也显得有了些意义。只有赶上时代，我们才可能超越时代，但愿某一天费力地翻译外文资料的，是洋人。　
　　
　　2.在反对进化论的文章中，我看到了二次以上的所谓“露西（Lucy）”的发现者承认Lucy系假造的说法。一时的心血来潮，我给那位尊敬的老博士发了邮件。在他的回信中，他肯定了Lucy系假造的说法系伪造。这种谣言的最初起源也许是某个小邮报，也许是某个垃圾网站的投稿人。但令人叹息的是真相的传播总是不如谣言快速，尤其是人们听到了自己想听到的谣言时。

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